Dos años después de la expulsión, la Parroquia de los Santos Juanes de Atxuri, se trasladó a lo que era la Iglesia, mientras que en el Claustro se instaló una casa de pupilaje para maestros de Primeras Letras, Latinidad y Retórica, así como la Santa Casa de Misericordia con sus talleres de imprenta-encuadernación, tejido y loza.
En julio de 1921 se abrió al público el Museo Arqueológico de Vizcaya y Etnográfico Vasco en la planta baja del Claustro, auspiciado por la Diputación Foral de Bizkaia y el Ayuntamiento de Bilbao, siendo nombrado Director, Don Jesús Larrea.
A medida que los edificios anexos se iban vaciando y las colecciones del Museo aumentando, se realizaron sucesivas obras de remodelación y ampliación, momento en que el Museo cambió su nombre por el de Museo Histórico de Vizcaya, siendo su Director Don Mario Grande.
El advenimiento de la democracia, devolvió su antiguo nombre al Museo, siendo el que conocemos hoy día, y se añadió el antiguo edificio de la Sta. Casa de la Misericordia, cuya fachada da a la Plaza de Miguel de Unamuno, donde se han albergado las áreas de trabajo e investigación, los almacenes y la sala de exposiciones temporales.
Sus colecciones, que recogen la Prehistoria y Arqueología del territorio de Bizkaia, y la Etnografía e Historia del País Vasco, en una concepción cultural que traspasa los límites de la Comunidad Autónoma actual, se estructuran en exposiciones permanentes que testimonian e ilustran los modos de vida que este Pueblo ha desarrollado a lo largo de la historia desde sus orígenes hasta la actualidad.
El complejo pastoril, el mundo del mar, la pesca y la navegación, las industrias ferrona y armera, la actividad mercantil y comercial, los oficios y artesanías tradicionales, son aspectos que pueden conocerse a través de sus salas, en una política de divulgación que se completa con una programación de exposiciones temporales de carácter monográfico que ha ido dando a la luz sus correspondientes catálogos y publicaciones.
Guías y folletos explicativos completan esta tarea de difusión, que es fruto y resultado final de una labor de adquisición e investigación definida por un objetivo preciso: dar a conocer la realidad cultural, el ser y la identidad del Pueblo Vasco, tanto en lo que tiene de propio, como en lo que tiene de común con otras comunidades y pueblos.
Contenidos
Prehistoria y Arqueología de Bizkaia. Historia y Etnografía vasca. Imaginería Religiosa. Artes Gráficas. Archivo Fotográfico. Archivo Documental Estoscontenidos, distribuidos en exposiciones o almacenes, se completan con un servicio de Biblioteca especializada, un área de exposición y venta de objetos de artesanía vasca y reproducciones de objetos de las colecciones del Museo.