La colección de Obras de Arte Religioso de la Diócesis de San Sebastián ubicada en el edificio de la Sagrada Familia de Amara, construido por el arquitecto Antonio Camuñas (1962) y reconstruido por Carlos Arruti (1991), trata de ser el inicio y fundamento de un Museo Diocesano al servicio de todo el País.

Manuel Lekuona y José Mª Zunzunegui fueron sus iniciadores. Actualmente se está recorriendo y rastreando, indagando e investigando en archivos y sacristías parroquiales, en iglesias, ermitas, conventos y casas parroquiales, la huellas de la historia religiosa plasmada y simbolizada en obras de arte.

Los fondos que configuran la colección se han ordenado diacrónicamente siguiendo grandes edades de la historia religiosa del hombre en el País Vasco:

1.- Los caminos del cristianismo. Edad Media: Románico y Gótico (S. XII-XV), destacando las siguientes piezas:  

• Santiago peregrino. S. XIII. Alabastro.
• San Martín. S. XIII. Madera policromada.
• Monje. S.XIV. Madera policromada.
• Restos de un retablo Flamenco. S. XV.
• Stas. Catalina y Apolonia de la Escuela de Nottinghan. S..XV. Alabastro.
• Copón. S. XV.

2.- Asentamiento y esplendor de la fe católica. Edad Moderna: Renacimiento y Barroco (S.XVI-XVIII), con piezas tales como:

• San Francisco. S. XVI. EL GRECO. 
• Tabla flamenca. S. XVI. 
• San Francisco. S. XVI. EL GRECO.
• Tabla flamenca. S. XVI.
• ríptico del Nacimiento. S. XVI.
• Cruces procesionales.
• Sagrario monumental de Alkiza. S. XVI. Ambrosio de Bengoechea

3.- Crisis y Resurgimiento. Edad Contemporánea: Neos y Arte contemporáneo (S.XIX-XX), con autores tan sobresalientes como Chillida y Oteiza